Uluslararası Balkan Üniversitesi, Üsküp'te öğrenim gören uluslararası ve yerel öğrencilerin konforlu, güvenli ve uygun maliyetli bir şekilde barınabilmeleri için çeşitli seçenekler sunmaktadır. Üniversite, öğrencilerin farklı ihtiyaçlarına ve bütçelerine uygun çözümler geliştirmeye özen göstermektedir. Üniversite tarafından yönetilen veya anlaşmalı öğrenci yurtları, öğrencilere temel yaşam olanaklarını sunan, genellikle kampüse yakın konumda veya toplu taşıma ile kolayca erişilebilir mesafelerde bulunan uygun fiyatlı konaklama imkanları sağlamaktadır. Bu yurtlar, öğrencilere hem bireysel çalışma alanları hem de sosyal etkileşim imkanları sunarak yeni bir ortama adapte olmalarına yardımcı olur. Yurtların aylık maliyetleri, sunulan olanaklara ve oda tiplerine göre değişiklik göstermekle birlikte, genellikle 250-350 Euro (2024-2025 Akademik Yılı) aralığında seyretmektedir. Bu fiyatlar, birçok Avrupa şehrine kıyasla oldukça ekonomiktir. Daha bağımsız bir yaşam tarzını tercih eden öğrenciler için Üsküp genelinde özel daire kiralama seçeneği de mevcuttur. Dairelerin kira ücretleri, konumlarına (şehir merkezine yakınlık, kampüse ulaşım), büyüklüklerine ve içerdikleri eşyalara göre farklılık göstermektedir. Tek odalı (stüdyo) bir dairenin aylık kirası yaklaşık 200-300 Euro (2024-2025 Akademik Yılı) civarında olabilirken, daha büyük daireler veya merkezi konumdakiler için bu fiyatlar artış gösterebilir. Maliyetleri düşürmek ve aynı zamanda sosyalleşmek isteyen öğrenciler için diğer öğrencilerle paylaşımlı daireler de oldukça popüler bir seçenektir; bu durumda kira ve fatura masrafları öğrenciler arasında paylaşıldığından, aylık yaşam giderleri daha uygun hale gelmektedir. Üniversite, özellikle uluslararası öğrencilerin konaklama süreçlerinde kapsamlı destek sağlamakta, güvenilir emlak danışmanlık firmalarıyla işbirliği yaparak öğrencilere uygun barınma seçenekleri bulmaları konusunda yardımcı olmaktadır. Ayrıca, öğrencilerin güvenliğini sağlamak amacıyla barınma alternatifleri hakkında detaylı bilgiler ve rehberlik sunulmaktadır.