Amasya Üniversitesi, çeşitli akademik programlarında akreditasyonlar elde ederek eğitim kalitesini belgelendirmiştir. Akreditasyonlar, programların ulusal ve uluslararası standartlara uygunluğunu gösterir ve öğrencilerin mezuniyet sonrası iş dünyasında daha rekabetçi olmalarını sağlar. Üniversitenin bazı bölümleri ve akreditasyonları şunlardır:

Mühendislik Fakültesi
Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü: MÜDEK (Mühendislik Eğitim Programları Değerlendirme ve Akreditasyon Derneği) tarafından akredite edilmiştir. Bu akreditasyon, 2020-2025 yılları arasında Bilgisayar Mühendisliği Bölümü: MÜDEK tarafından akredite edilmiştir. Bu akreditasyon, 2021-2026 yılları arasında geçerlidir.

Fen-Edebiyat Fakültesi
Kimya Bölüm: FEDEK (Fen, Edebiyat, Fen-Edebiyat, Dil ve Tarih-Coğrafya Fakülteleri Dekanlar Konseyi) tarafından akredite edilmiştir. Bu akreditasyon, 2019-2024 yılları arasında geçerlidir.
Matematik Bölümü: FEDEK tarafından akredite edilmiştir. Bu akreditasyon, 2020-2025 yılları arasında geçerlidir.

Eğitim Fakültesi
İköğretim Matematik Öğretmenliği Bölümü: EPDAD (Eğitim Programları Değerlendirme ve Akreditasyon Derneği) tarafından akredite edilmiştir. Bu akreditasyon, 2021-2026 yılları arasında geçerlidir.
Fen Bilgisi Öğretmenliği Bölüm: EPDAD tarafından akredite edilmiştir. Bu akreditasyon, 2022-2027 yılları arasında geçerlidir.

Sağlık Bilimleri Fakültesi
Hemşirelik Bölümü: SABAK (Sağlık Bilimleri Eğitim Programları Değerlendirme ve Akreditasyon Derneği) tarafından akredite edilmiştir. Bu akreditasyon, 2018-2023 yılları arasında geçerlidir.

Bu akreditasyonlar, Amasya Üniversitesi'nin eğitim programlarının kalitesini ve uluslararası standartlara uygunluğunu göstermektedir. Akredite olan programlar, öğrencilerin mezuniyet sonrası iş dünyasında daha rekabetçi olmalarına yardımcı olur.