Kırgızistan-Türkiye Manas Üniversitesi, öğrencilerinin ve personelinin sağlık ve esenliğini ön planda tutarak kampüs içerisinde kapsamlı sağlık hizmetleri sunmaktadır. Üniversite bünyesinde iki adet sağlık merkezi bulunmaktadır: biri Merkez Bina'da, diğeri ise Cengiz Aytmatov Kampüsü'nde. Bu sağlık merkezleri, alanlarında uzman tıp görevlileri ile donatılmıştır ve öğrencilerin temel sağlık ihtiyaçlarını karşılamak üzere tasarlanmıştır. Merkezler, küçük yaralanmalar, genel sağlık sorunları için ilk yardım hizmetleri, rutin sağlık kontrolleri ve gerektiğinde basit tibbi müdahaleler için hazırdır. Tıp görevlileri, 24 saat gerektiği durumlarda müdahale edebilecek bilgi ve teknik donanıma sahiptirler. Daha ileri düzeyde sağlık hizmetleri veya uzman hekim muayenesi gerektiren durumlarda, öğrenciler Bişkek şehrindeki yerel hastanelere ve tıp merkezlerine yönlendirilir. Kırgızistan'da hem devlet hem de özel sağlık kuruluşları bulunmaktadır. Üniversite, öğrencilerin bu hizmetlere erişimi konusunda detaylı bilgi ve yönlendirme sağlayarak, acil durumlarda veya rutin kontrollerde hızlı ve doğru sağlık hizmetlerine ulaşabilmeleri için gerekli desteği sunar. Uluslararası öğrenciler için, Kırgızistan'da eğitim süreleri boyunca geçerli olacak bir sağlık sigortası yaptırmaları genellikle tavsiye edilir veya zorunlu tutulabilir. Üniversite, bu konuda öğrencilere rehberlik etmekte ve sigorta süreçleri hakkında bilgi sağlamaktadır.