Başkent Üniversitesi, 13 Ocak 1994 tarihinde 3961 sayılı kanunla, Haberal Eğitim Vakfı ile birlikte kurulmuştur. Kökeni bir organ nakli ve yanık tedavisi vakfına, ardından bir diyaliz merkezine ve hastaneye uzanır; eğitim faaliyeti önce Bahçelievler'de başlamış, 1995-1996 öğretim yılında Ankara-Eskişehir karayolu üzerindeki Bağlıca Kampüsü'ne taşınmıştır. Bugün lisans düzeyindeki tüm fakülteler, yüksekokullar ve enstitüler bu kampüste eğitim veriyor; sağlık alanındaki bazı fakültelerin klinik uygulama eğitimi ise Ankara Hastanesi başta olmak üzere üniversitenin kendi sağlık kuruluşları ağında, şehir içindeki Bahçelievler yerleşkesinde ve farklı illerdeki uygulama-araştırma merkezlerinde sürüyor. Önlisans düzeyinde ise coğrafya daha dağınık: bazı meslek yüksekokulları Kahramankazan, Malıköy (Sincan) gibi Ankara'nın farklı noktalarında, Adana ve Konya'daki sağlık hizmetleri meslek yüksekokulları da o şehirlerde kayıt ve eğitim yürütüyor.

Öğretim dili varsayılan olarak Türkçedir; belirli programlar dışında dersler Türkçe işlenir, ancak üniversiteye kabul edilen lisans öğrencileri bir İngilizce yeterlik sınavına girer ve yeterli görülmeyenler İngilizce hazırlık programına devam eder. Hazırlıkta hedeflenen düzey CEFR ölçeğinde B2 olarak belirtiliyor; bölüme başladıktan sonra da öğrencinin karşısına Akademik, Mesleki ve Genel İngilizce gibi program-içi İngilizce dersleri çıkabiliyor. Önlisans ve konservatuvar öğrencileri için bu sınava girmek isteğe bağlı. Fakülte yelpazesi sağlık alanının ötesine geçiyor; tıp, diş hekimliği, eczacılık ve sağlık bilimleri gibi sağlık kökenli birimlerin yanında hukuk, mühendislik, iletişim, eğitim, fen-edebiyat, güzel sanatlar-tasarım-mimarlık ve iki ayrı işletme-yakını fakülte ile karma bir akademik gövde oluşuyor. Devlet Konservatuvarı, müzik ve sahne sanatları bölümleriyle özel yetenek sınavıyla öğrenci alıyor ve kendi akademik orkestrasıyla eğitimi iç içe yürütüyor.

Kampüs yaşamı bakımından Bağlıca'da öğrencilerin kullanımına açık bir merkez kütüphane bulunuyor; kendi ifadesiyle 12.500 metrekarelik alanı ve 1627 kişilik oturma kapasitesiyle geniş bir çalışma mekânı sunuyor, sınav dönemlerinde giriş katı 7/24 açık tutuluyor. Kampüste ayrıca bir mediko-sosyal sağlık merkezi, engelli öğrencilere yönelik bir birim ve bu birime bağlı akademik uyarlama mekanizması, kütüphanede görme engelli öğrencilere yönelik özel donanımlı bir oda ve kampüs içi bir navigasyon uygulaması yer alıyor. Barınma tarafında 1996'dan itibaren hizmet veren, kız ve erkek öğrencilere ayrılmış bloklardan oluşan yurtlar kampüs içinde konumlanmış durumda; yurt ilişkisi her öğretim yılı sonunda kendiliğinden sona eriyor ve kalmak isteyen öğrenci kaydını yeniden yapıyor. Eğitim yarıyıl esasına dayanıyor, güz ve bahar dönemlerinin her biri en az on dört hafta sürüyor; Tıp Fakültesi bu genel yapının dışında kendi yıl esaslı programını uyguluyor. Uluslararası hareketlilik tarafında Erasmus+ çerçevesinde öğrenim ve staj değişimi yürütülüyor, katılım için en az B1 düzeyinde İngilizce aranıyor; kampüste gelen ve giden değişim öğrencilerini bir araya getiren bir topluluk da bulunuyor. Ayrıca Teknoloji Transfer Ofisi, bir ön kuluçka merkezi ve teknoloji geliştirme merkezi gibi yapılar üzerinden öğrencilere girişimcilik alanında destek sunulduğu belirtiliyor.